简介自序凡例卷首卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十卷十一卷十二卷十三卷十四卷十五卷十六
注序补注《明医杂着》序卷之一仲景东垣河间丹溪诸书孰优处方药品多少论异法方宜论丹溪治病不出乎气血痰郁产后发热伤寒时气病后调养泄泻劳热饮食劳倦内伤发热伤寒发热伤暑发热病有感伤中心腹疼痛病时静心息虑发热论补
刻针灸问对叙序卷之上卷之中三才法候气法十四法卷之下十五络脉歌周身经穴相去分寸歌肺经大肠经胃经脾经心经小肠经肾经膀胱经心包络经三焦经胆经肝经督脉任脉经穴起止歌十二经纳支干歌天心十一穴歌经脉交会八穴歌八会
七十二症辨治方法
叙卷上卷上一卷上二卷上三卷上四卷上五卷上六卷下卷下一卷下二卷下三卷下四卷下五
卷一用药弊端说卷一各症辩认阴阳用药法眼心病不安肺病咳嗽肺痿肺痈胃病不食脾病呕吐泄泻肝病筋挛肾病腰痛头痛目病耳病肿痛鼻流清涕鼻孔煽动唇口红肿齿牙肿痛口臭[附:口苦、口酸、口辛、口甘、口淡、口糜]舌肿、舌
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
卷一九针十二原第一（法天）本输第二（法地）小针解第三（法人）邪气脏腑病形第四（法时）卷二根结第五（法音）寿夭刚柔第六（法律）官针第七（法星）本神第八（法风）终始第九（法野）卷三经脉第十经别第十一经水第
第1部分第2部分第3部分
序叙自序卷之一·述古卷之二·论治瘟疫名义论疫病有三种论用党参宜求真者论治瘟疫慎用古方大寒剂论用大黄石膏芒硝论立方用药论疫症繁多论治疫症最宜变通论抄复论仅读伤寒书不足以治瘟疫不读伤寒书亦不足以治瘟疫论读