前言卷第一摄生之一（佚）卷第二摄生之二（卷末缺）顺养六气九气调食寿限卷第三阴阳阴阳大论调阴阳阴阳杂说卷第四（佚）卷第五（卷首缺）人合阴阳合四海合十二水卷第六（卷首缺）脏腑之一五脏命分脏腑应候脏腑气液卷
医经读
叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
序原序卷一调经上月经先期月经后期月经或前或后月经愆期过期经行形瘦经不调形瘦过期经行形肥过期经行一月经再行每月经来二三次经来不止数月行经经来色紫经来色淡形瘦经少形肥经少经来过多经来如猪肝水经来如屋漏水经
叙卷之一调经总论经候卷之二血崩带下淋浊卷之三妊娠临蓐卷之四产后
进表卷一治诸风（附香港脚）至宝丹灵宝丹润体丸乌犀丸牛黄清心丸摩挲丸透冰丹龙脑天麻煎牛黄小乌犀丸娄金丸龙虎丹麝香天麻丸龙脑芎犀丸银液丹和太师牛黄丸碧霞丹雄朱丸八风丹牛黄生犀丸辰砂天麻丸青州白丸子辰砂丸牛
概述卷一阴阳颠倒篇顺逆探原篇回天生育篇天人寿夭篇命根养生篇救母篇红铅损益篇初生微论篇骨阴篇卷二媾精受妊篇社生篇天厌火衰篇经脉相行篇经脉终始篇经气本标篇脏腑阐微篇考订经脉篇包络配腑篇卷三胆腑命名篇任督死
养生肤语
序一序二序三自序凡例卷之一伤寒门（四十三则）中寒门（七则）卷之二中风门（二十五则）痹证门（十一则）心痛门（六则）胁痛门（五则）头痛门（六则）腹痛门（六则）腰痛门（六则）卷之三咽喉痛门（七则）牙齿痛门（
卷一月经门诸论经病门诸论崩漏门诸论带下门诸论女科杂症门热入血室血分水分炙脔梅核瘕癖乳症前阴诸症？？足跟疮肿疮血风疮梦与鬼交卷二嗣育门绪论受胎总论胎前杂症门恶阻子烦妊娠烦躁口干子悬子满子肿子气妊娠腹痛胎